L'histoire de Naruto-Future-RPG se déroule 100 ans après la mort de Naruto Uzumaki, l'homme qui a eu le règne d'Hokage la plus longue de l'histoire de Konoha. Madara Uchiwa et l'akatsuki ont perdu la guerre et tout les Bijuus sont retourner dans leur village respectif.
Beaucoup de choses ont changé depuis la 4eme grande guerre shinobi. Le clan Uchiwa s'est reformé dans Konoha. Un survivant du clan Kaguya a recréé le clan à Kirigakure. De plus, Kirigakure a récupéré toutes les épées de la brume. Il n'y a plus 5 grands pays ninja, mais 6: un shinobi s'est installé à Otogakure et a développé le village.
Même si le monde connait sa plus grande période de paix, un nouvel ennemi à reconstruit l'akatsuki dans le plus grand secret. Comme l'ancien akatsuki, cet ennemi tente de capturer les jinchurikis pour un plan inconnu. Personne ne se doute que l'akatsuki est recréé.
Naruto Uzumaki était le 7e Hokage.
Konoha en est au 8e Hokage.
Sunagakure en est au 8e Kazekage.
Kirigakure en est au 9e Mizukage
Kumogakure en est au 7e Raikage.
Iwagakure au 6e Tsuchikage.
Otogakure au 3e Nekage.
Tout les personnages de Naruto sont mort. Les membres du forum doivent créer leur propre personnage. Vous pouvez le créer avec un don héréditaire ou non.